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nr,nt,swissprot,cog,kegg是什么意思?

返回>来源:365bet网投官网   发布时间:2019-06-09 13:26    关注度:

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NR文库属于非重叠蛋白质序列数据库,是NCBI蛋白质序列的官方数据库。数据来自GenPept,SwissProt,PIR,PDF,PDB和NCBIRefSeq。这是默认的蛋白质比对数据库。
NT数据库是来自国家生物技术信息中心的NCBI核酸序列的官方数据库。NT文库属于非重叠核酸序列的数据库。数据来自GenBank,EMBL和DDBJ。这是NCBI的默认核酸braser比对数据库。
SwissProt数据库是一个带注释的蛋白质数据库,手动注释,并将Unigene注释到SwissProt数据库,以获得更高质量的注释结果。
COG(簇正交组)主要是原核生物和单细胞真核生物的直向同源物。KOG数据库(clusterofeu KaryoticOrtholog Groups)包含来自真核直系同源家族的七种完整蛋白质的基因组,构成每种KOG的蛋白质组是系统发育上分类的祖先蛋白质,通常它似乎源于COG。通过原核生物,KOG意味着真核生物,KOG和COG为基因同源物提供类似的分类信息。
KEGG(基因和京都百科全书的基因组)是处理基因组,生物途径,疾病,药物,化学物质的相关性的综合数据库。
KEGG是,基因组学,代谢组学和药物开发,细胞过程,环境信息处理,遗传信息处理,已生物信息学研究被用于包括其它组学数据分析,如遗传信息的处理。,生物系统等
GO(基因本体论):基因本体论。
生物技术发展迅速,数据不断增长,各种数据库名称标准也不统一。为了解决不同生物数据库可以使用不同术语的问题,Gene Onoline Consortium开发GO并描述细胞,组织和组织水平的分子功能表达内的基因。
GO的基本解释单元是GOterms。
GO主要由三个方面组成:生物过程,分子功能和细胞成分。这些用于解释基因产物的功能。
GO使用三种交互:is_a,part_of和regula。


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